重庆科学家绘制全球首张家蚕超级泛基因组图谱

　　文章封面和表型图。受访单位供图
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　　10月9日，西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室发布全球首张家蚕超级泛基因组图谱，并率先创建“数字家蚕”基因库，将我国的家蚕基因研究推向设计育种阶段。相关研究论文日前在国际期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表。
　　该实验室公布545个长读长测序的样本，是迄今为止动植物中规模最大的长读长泛基因组。不仅如此，实验室还完成了家蚕大规模种质资源基因组解析，在世界上率先实现家蚕基因库数字化，创建“数字家蚕”。
　　对于家蚕基因的研究，此前仅有单一参考基因组及部分重测序数据，尚不足以支撑基因组变异和优良基因的深度挖掘，尤其对于分子育种具有显著局限。
　　此次发布的超级泛基因组图谱是一个物种所有基因组信息的总和，西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室教授、博士生导师童晓玲介绍，这对深化功能基因组研究、种质创新等意义重大。
　　童晓玲表示，作为世界家蚕基因组研究的新里程碑，这一成果将开启家蚕设计育种和多元创新利用新时代。这也意味着，今后相关领域的科学家拥有了一本详尽的“字典”，可按需要，有针对性地对家蚕进行设计育种。


　　向仲怀院士。华龙网-新重庆客户端 记者 秦思思 摄
　　为全面反映家蚕所有基因组的信息，从2019年开始实验团队对1078份蚕种质资源（47个野桑蚕、205个家蚕地方种、194个实用种和632个突变体）进行了深度二代测序。
　　“以前的家蚕群体基因组学研究样本数目都只有几十或百多个，且都是基于二代测序技术，测序读长短，样本少，获得的信息有限。本项目的测序样本数超过了1000份，样本规模大、覆盖范围广，且主要是三代测序数据，也因此获得了最广泛的家蚕遗传变异信息。”童晓玲说道。
　　“该研究成果完成基因组测序的家蚕材料，涵盖全世界90%以上的家蚕代表性种质资源。”蚕学遗传育种专家、中国工程院院士向仲怀表示，未来研究人员可快速、精准地找到负责表型的基因组序列，对解释家蚕遗传多样性产生的奥秘具有重大的推动作用。
　　来源：华龙网-新重庆客户 端（记者 秦思思） 编辑：邹景韬推荐阅读：重庆四地入选！2022年国家乡村振兴示范县创建名单公示！
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